La Institución Educativa “Isabel la Católica” fue creada como colegio Nacional en el distrito de La Victoria por Resolución Suprema N° 46.de fecha 07 de marzo de 1956, siendo Presidente de la República el General Manuel Odría y Ministro de Educación el General Juan Mendoza Rodríguez.
Inició su funcionamiento en un local provisional en la cuadra 10 de la Av Manco Cápac, siendo su primera Directora la Dra Aurea Tejada Barba.
Funcionó inicialmente con seis secciones de Educación Secundaria, con un total de 280 alumnas.
En el año de l957, es elevado a la categoría de Gran Unidad Escolar y se traslada a un nuevo local, en la Av. Isabel la Católica N°872, cuya área es de 12 000 m2, con 120 m de fondo y 100m de frente, entre las manzanas G12 y G13 de la Unidad Vecinal Matute.
Como Gran Unidad Escolar, además del nivel primario y secundario la integraron:
- El Instituto Nacional de Comercio N° 33 creado el 11 de marzo de 1957.
- El Instituto Nacional Industrial N° 27(Técnica).
- Sección Vespertina.
La Institución Educativa “Isabel la Católica” experimentó el proceso de conversión y nuclearización, así como su adecuación a la Ley de Educación.
En el año de 1984 se puso en práctica la Nueva Organización y la Educación Secundaria diversificada, que atiende a las áreas de Ciencias y Humanidades y las áreas de formación Técnica, que imparte diversas especialidades, capacitando al alumnado para la vida y trabajo, como son:
En Comercio: Contabilidad, Secretariado y Computación.
En Industria: Vestido, Cosmetología y Artesanía.
